В Центре пульмонологии и аллергологии постоянно ведется разносторонняя педагогическая деятельность. Центр пульмонологии и аллергологии Сантаришкских клиник Вильнюсской университетской больницы как часть Клиники инфекционных болезней, заболеваний органов грудной полости, дерматовенерологии и аллергологии Вильнюсского университета является учебной базой для студентов 4 и 5 курсов. Для студентов 4 курса здесь проводятся практические занятия и лекции по аллергологии, а для студентов 5 курса – по пульмонологии и фтизиатрии. Ежегодно пульмонологию и аллергологию в Центре изучают более 250 студентов Медицинского факультета Вильнюсского университета.
В Центре пульмонологии и аллергологии ежегодно повышают свою квалификацию в области пульмонологии и аллергологии более 100 врачей различных специальностей. В настоящее время в Центре проводятся следующие курсы для врачей: «Актуальные вопросы пульмонологии и аллергологии» (2 недели), «Дифференциальная диагностика и лечение туберкулеза органов дыхания» (1 неделя), «Избранные вопросы пульмонологии» (2 недели), «Избранные вопросы пульмонологии и торакальной хирургии» (1 неделя), «Фармакотерапия болезней легких и аллергических заболеваний» (1 неделя), «Диагностика и лечение аллергических заболеваний» (1 неделя).
Ежегодно клиническую ординатуру в Центре проходят несколько десятков учащихся различных врачебных специальностей. В рамках четырехлетней клинической ординатуры Центр ежегодно выпускает по 5-6 врачей-специалистов – пульмонологов, аллергологов и клинических иммунологов.
